外部故障切除后变压器差动保护误动时有发生，目前主要通过改变比率制动的动作区与制动区来防止误动，却给快速切除转换性故障带来不利影响。对差流的谐波进行了详细的仿真分析，依据误动期间三次谐波含量比二次谐波含量大的特点，提出了一种防止外部故障切除后变压器差动保护误动的新算法。该算法在二次谐波制动的差动保护基础上，利用差流中二次谐波和三次谐波占基波的比例构成新的制动判据。通过大量仿真试验，表明该算法简单易行，既能有效防止外部故障切除后变压器误动，也能迅速切除外部故障切除后的转换性故障。