电力系统的故障电流中存在指数函数型衰减直流信号，直接采用离散傅里叶变换（DFT）算法测量基波电流的误差较大。提出一种从故障电流信号中消除衰减直流分量的新算法，基于纯正弦波信号在一个全波周期积分为零、而指数衰减信号在一个全波周期积分不为零的原理，用一个全波周期加前一个采样周期的采样数据，就能精确估计出指数函数型衰减直流信号的幅值和时间常数。每个采样数据减去衰减直流分量偏移量后，用全波DFT算法就可精确估计故障电流。在Matlab仿真平台上，进行综合仿真试验表明：所提算法测量精度高，易于用DSP实现，可应用到基于DSP的数字继电保护装置中。