电磁兼容一直以来都是微机保护装置开发研究的重点。文中分析了干扰的主要来源及其对微机保护装置的影响。共模干扰和差模干扰是各种电磁干扰在微机保护装置中的主要表现形式，可以通过减弱干扰源的辐射，阻塞干扰的耦合通道，增强敏感回路的抗干扰能力和合理设计泄放通道进行抑制。提出的措施包括对电源进行滤波，合理布局元器件和合理设计电路接地，对开关量输入输出、通信接口良好隔离等。这些措施应用于一套微机保护装置中并使其顺利通过Ⅳ级电磁兼容试验。